В результате нового воздействия представлен сокращенный список представленных на рынке видов диких животных, из которых в конце 2019 года, скорее всего, возник вирус SARS-CoV-2, ответственный за пандемию COVID-19.
Введение
Исследование, опубликованное в четверг в журнале Cell, основанное на анализе генетических данных, опубликованных Китайским центром по контролю и контролю. заболевания. Результаты получены из более чем 800 образцов, собранных на оптовом рынке морепродуктов Хуанань в Ухане, Китай, и вокруг него, начиная с 1 января 2020 года, а также из вирусных геномов пациентов с COVID-19.
Возможно, это последний большой, новый набор данных, находящихся непосредственно на рынке, и в каком-то смысле это выглядит как завершение сбора последних кусочков головоломки, показывающей довольно широкую картину, которая и так была ясна. Мы представляем серьезный и скрупулезный анализ полученных данных, и то, как они соотносятся с массивом информации, как свидетельства о том, как началась пандемия.
Майкл Воробей, один из трёх соавторов статей и заведующий кафедрой экологии и эволюционной биологии Университета Аризоны. Майкл Воробей, один из трёх соавторов статей и заведующий кафедрой экологии и эволюционной биологии Университета Аризоны
1 января 2020 года, Несмотря на то, что почти не встречали живую природу, они протерли швабрами поля, стены и другие поверхности в стойлах. несколько дней спустя, чтобы сосредоточиться на поверхностных слоях в киосках, где продавалась дикая природа, такие как клетки и тележки, используемые для перевозки животных, а также собрали образцы из канализационных стоков.
Они выполнили метатранскриптомное секвенирование образцов — метод, используемый для получения последовательностей РНК (и который также может улавливать ДНК) от всех организмов, присутствующих в образцах — вирусов, бактерий, растений, животных и людей.
Команда китайского CDC под руководством Лю Цзюня опубликовала свои данные и результаты в 2023 году в журнале Nature. Однако статья оставила невыясненной точную идентификацию видов животных, обнаруженных в данных. Китайский CDC поделился данными секвенирования в публичных и открытых репозиториях. Согласно последнему анализу данных, SARS-CoV-2 присутствовал в некоторых из тех же ларьков, где на рынке продавались дикие животные.
В перечень диких животных входили енотовидные собаки – маленькие лисьеподобные животные с отметинами, похожими на енотов, – и циветты – мелкие плотоядные млекопитающие, родственные мангустам и гиенам. В некоторых случаях генетический материал вируса SARS-CoV-2 и этих животных был обнаружен в одних и тех же мазках.
Многие ключевые виды животных были уничтожены до прибытия китайских команд CDC, поэтому у нас нет прямых доказательств того, что животные были заражены. Мы видим призраки ДНК и РНК этих животных в образцах окружающей среды, а некоторые из них находятся в стойлах, где также был обнаружен SARS-CoV-2. Это то, что можно было бы ожидать в случае, когда в рынок.
Соавтор Флоранс Дебарриз Французского национального центра научных исследований.
Искра в пороховой бочке
По словам Воробея, контакт диких животных с вирусами с людьми в центре крупных городов, где плотность населения позволяет этим вирусам легко распространяться, является одним из самых рискованных действий человека.
Новый способ характеристики биомолекул Электронная книга Узнайте о масс-фотометрии, революционном способе характеристики биомолекул, с помощью этой бесплатной электронной книги.
Не все эти вирусы обладают потенциалом начать пандемию, но когда вы их приносите, это как искра в пороховой бочке. Исследователи также провели эволюционный анализ самых ранних вирусных геномов, зарегистрированных во время пандемии. Результаты показывают, что до вспышки на рынке было очень мало инфицированных людей, если таковые вообще были. Это согласуется с перетеканием от животных к людям на рынке, а затем последующим распространением по Уханю и, в конечном итоге, по всему миру, сказал Воробей.
Хотя данные не могут доказать, были ли заражены одно или несколько из этих животных, анализы дают четкий список видов, которые, скорее всего, могли переносить вирус.
Исследование также представляет наиболее полную запись видов животных и конкретных популяций внутри этих видов, которые могли выступать в качестве промежуточных хозяев на рынке, сказал Воробей.
«Это дает нам подсказки о популяциях, которые были представлены там для каждого вида», – сказал он. «Где в Юго-Восточной Азии они жили? Откуда они могли появиться? Сколько из них были выращены на фермах или пойманы в дикой природе, а затем перемещены в транспортные сети нелегальных диких животных?»
Хотя с начала пандемии более четырех лет назад уделялось повышенное внимание безопасности в лабораториях, Воробей говорит, что «удивительно мало было сделано для снижения риска повторного перехода вируса от дикой природы к людям».
«Нам нужно начать применять доказательства того, как началась эта пандемия, приняв серьезные, конкретные меры, чтобы остановить опасную практику ввоза живых животных с потенциальными пандемическими патогенами в густонаселенные городские районы», – сказал он.
Список литературы
Crits-Christoph, A., et al. (2024). Genetic tracing of market wildlife and viruses at the epicenter of the COVID-19 pandemic. Cell. doi.org/10.1016/j.cell.2024.08.010